Pedagojik Formasyon Eğitimi Sertifikasyon Programının eğitim ve öğretim süresi güz ve bahar olmak üzere iki yarıyıldır. Bir yarıyıl,  14 haftadan oluşmaktadır. Formasyon programları Fatih Sultan Mehmet Vakıf Üniversitesi Eğitim Fakültesi Pedagojik Formasyon Eğitimi Sertifika Programı Yönergesi’ne uygun olarak yürütülmektedir. Bu yönergede belirtilmeyen eğitim ve öğretimle ilgili işler ve disiplin konularında, Fatih Sultan Mehmet Vakıf Üniversitesi Önlisans ve Lisans Eğitim-Öğretim ve Sınav Yönetmeliği ile Yükseköğretim Kurumlarının Öğrenci Disiplin Yönetmeliği’nin hükümleri uygulanmaktadır.